Soms reikt een gaatje tot in de tandzenuw of sterft de tandzenuw af door invloed van buitenaf. Dat kan onopgemerkt gebeuren of gepaard gaan met pijn en zwelling (een abces). In dat geval is het nodig om de wortelkanalen van de tand te ontsmetten en op te vullen. Deze behandeling is technisch niet altijd eenvoudig en vraagt vaak een langere afspraak of soms een verwijzing naar een specialist die de tand onder microscoop kan behandelen. Tijdens een wortelkanaalbehandeling wordt de tand steeds afgezonderd onder rubberdam. Dit is een rubberen doekje dat ervoor zorgt dat er geen speeksel of bacteriën in de tand terecht kunnen komen en zo de tand opnieuw besmetten. De rubberdam zorgt er ook voor dat er geen hinderlijke producten of instrumenten in de mond terecht kunnen komen.